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本發明提供一種基于分形理論和BP算法的魚識別及疫苗注射方法，包括：獲取魚的彩色圖像；對所述彩色圖像進行預處理、圖像分割獲取目標圖像；運用分形理論算法提取分割后各目標圖像的特征值，得到綜合特征向量組；用BP神經網絡算法對所述綜合特征向量組進行訓練，在所述目標圖像中識別出符合魚特定部位組合要求的圖像；符合要求的魚進行疫苗注射。本發明采用分形理論算法為魚身體部位表征提供了全新的方法，8個表征魚的特征值更能反映魚的身體部位信息便于區分。分形理論和BP算法結合有效識別出魚頭及背脊組合要求的圖像，為魚疫苗注射提供一個很好的識別方法，實現機器化識別，注射過程也采用自動化注射，減輕人工負擔。